ITS1 va ITS2 oʻrtasidagi asosiy farq shundaki, ITS1 eukariotlarda 18S va 5.8S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNK, ITS2 esa eukariotlarda 5.8S va 28S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNKdir.
Ichki transkripsiyalangan ajratuvchi (ITS) odatda xromosomadagi kichik subunit ribosoma RNK va katta subunit ribosoma RNK genlari oʻrtasida yoki polikistronik rRNK prekursor transkripsiyasi molekulasidagi mos transkripsiyalangan hududda joylashgan ajratuvchi DNKdir. Bakteriyalar va arxeyalarda 16S va 23S rRNK genlari orasida faqat bitta ITS mavjud. Ammo eukariotlarda ikkita ITS ajratuvchi DNK mavjud: ITS1 (18S va 5.8S rRNK genlari) va ITS2 (5,8S va 28S rRNK orasida). Shuning uchun ITS1 va ITS2 eukariotlardagi rRNK genlari orasida joylashgan ikkita ajratuvchi DNKdir.
ITS1 nima?
ITS1 - eukariotlarda 18S va 5.8S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNK. ITS rRNK genlari orasida joylashgan funktsional bo'lmagan ajratuvchi DNKning bir qismiga ishora qiladi. ITS1 ITS2 dan ko'ra kattaroq uzunlikka ega. ITS1 uzunligining o'zgarishi taxminan (200-300bp). ITS1 kabi ITS markerlari turli taksonlar orasidagi filogenetik munosabatlarni yoritishda samaradorligini isbotladi. Bundan tashqari, ITS1 spacer DNK ITS2 spacer DNKga qaraganda kamroq saqlanadi. ITS1 tuzilmalari faqat ancha kichik taksonomik birliklarda saqlanadi. Har bir eukaryotik ribosoma klasterida tashqi transkripsiyalangan ajratgichlar (5’ va 3’ ETS) deb ataladigan hududlar ham mavjud.
01-rasm: ITS1 hududi
ITS1 ajratuvchi DNK 5'tashqi transkripsiyalangan spacerga (5' ETS) juda yaqin. Bundan tashqari, agar kimdir filogenetik munosabatlarni o'rganish uchun ITS1 mintaqasini kuchaytirmoqchi bo'lsa, bu maqsad uchun ma'lum bir primer juftligini (teskari va oldinga primerlar) ishlatishi kerak. ITS1 hududini kuchaytirish uchun laboratoriyalarning PCR protokollarida odatda ikkita primer to'plami qo'llaniladi. Ular ITS1 oldinga va ITS2 teskari yoki ITS1 oldinga va ITS4 teskari.
ITS2 nima?
ITS2 - eukariotlarda 5,8S va 28S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNK. ITS2 mintaqasi ITS1 hududiga qaraganda qisqaroq uzunlikka ega. ITS2 uzunligining o'zgarishi taxminan (180-240bp). Biroq, ITS2 mintaqasi ko'plab taksonomik birliklarda ITS1 mintaqasiga qaraganda ko'proq saqlanadi. Bu barcha ITS2 ketma-ketliklari ikkilamchi tuzilmaning umumiy yadrosiga ega ekanligini aniqlaydi. Bundan tashqari, ITS2 hududining 40% barcha angiospermlar orasida saqlanib qolgan, shu bilan birga ITS2 hududining 50% ni oila va undan yuqori darajaga moslashtirish mumkin.
02-rasm: ITS2 hududi
Muhofaza qilish koʻlamidan qatʼi nazar, ITS2 mintaqasidan foydalanish filogenetik munosabatlarni oʻrganishda, ayniqsa zamburugʻli DNK shtrix kodlashda ITS1 mintaqasi kabi juda mashhur. ITS2 hududini kuchaytirish uchun odatda laboratoriyalarning PCR protokollarida maxsus primer to'plami qo'llaniladi. Bu ITS1 oldinga va ITS4 teskari. Ammo PCR protokoli ushbu primer to'plamidan foydalanganda, u ITS1 mintaqasini ITS2 mintaqasi bilan birga kuchaytiradi. Bundan tashqari, ITS2 ajratuvchi DNK 3'tashqi transkripsiyalangan ajratgichga (3' ETS) juda yaqin.
ITS1 va ITS2 oʻrtasidagi oʻxshashliklar
- ITS1 va ITS2 rRNK genlari orasida joylashgan ikkita ajratuvchi DNKdir.
- Ular faqat eukariotlarda mavjud.
- Ikkalasini ham maxsus primer juftlari yordamida kuchaytirish mumkin.
- Ularning ikkalasi ham rRNKning yetilishida funktsional boʻlmagan qoʻshimcha mahsulot sifatida ajratiladi.
- Ikkalasi ham filogenetik munosabatlarni oʻrganish uchun, ayniqsa zamburugʻli DNK shtrix kodlashda juda muhim.
ITS1 va ITS2 oʻrtasidagi farq
ITS1 eukariotlarda 18S va 5.8S rRNK genlari orasida mavjud boʻlgan ajratuvchi DNK, ITS2 esa eukariotlarda 5.8S va 28S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNK. Shunday qilib, bu ITS1 va ITS2 o'rtasidagi asosiy farq. Bundan tashqari, ITS1 ITS2 bilan solishtirganda ko'proq uzunlik o'zgarishiga ega. Boshqa tomondan, ITS2 ITS1 bilan taqqoslaganda qisqaroq uzunlikdagi o'zgarishlarga ega. Bu ITS1 va ITS2 o'rtasidagi yana bir farq.
Quyidagi infografikada ITS1 va ITS2 oʻrtasidagi farqlar jadval koʻrinishida yonma-yon taqqoslash uchun berilgan.
Xulosa – ITS1 va ITS2
Ichki transkripsiyalangan hudud (ITS) rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNKning funktsional bo'lmagan qismidir. Bakteriyalar va arxeyada faqat bitta ITS hududi mavjud. Ammo eukariotlarda ikkita ITS hududi mavjud: ITS1 va ITS2. ITS1 eukariotlarda 18S va 5,8S rRNK genlari orasida joylashgan, ITS2 esa eukariotlarda 5,8S va 28S rRNK genlari orasida joylashgan ajratuvchi DNK. Shunday qilib, bu ITS1 va ITS2 o'rtasidagi farqning qisqacha mazmuni.
